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Neuartiger NGS-basierter Assay bietet grenzenlosen Virusnachweis

Wissenschaftler am Center for Infection and Immunity (CII) an der Mailman School of Public Health der Columbia University haben eine Sequenzierungstechnologie der nächsten Generation (NGS) entwickelt, die Oligonukleotide (Oligos) – kurze Einzelstränge synthetischer DNA – als Köder für relevante Nachweisziele einsetzt. Das neue agnostische Diagnostikum, bekannt als Virom-Capture-Sequenzierungsplattform für Wirbeltierviren (VirCapSeq-VERT), übertrifft bestehende NGS-Plattformen in Bezug auf Geschwindigkeit, Empfindlichkeit und Kosten in seiner Fähigkeit, jedes Virus zu identifizieren, das möglicherweise Menschen infizieren kann, einschließlich der unbekannten Viren mit pandemischem Potenzial, so Vishal Kapoor, stellvertretender Direktor des CII für Labormedizin.

Die beeindruckende Leistung des Screening- und Überwachungssystems für das öffentliche Gesundheitswesen wurde in einer Validierungsstudie hervorgehoben, die kürzlich imJournal of Clinical Microbiology (DOI: 10.1128/jcm.00612-23) veröffentlicht wurde.VirCapSeq-VERT wies eine nahezu perfekte Genauigkeit auf und konnte Co-Infektionen diagnostizieren, die von Vergleichstests, einschließlich der Polymerase-Kettenreaktion (PCR) mit einem einzigen Wirkstoff und dem BioFire RP FilmArray, nicht erkannt wurden.

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